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生命情報研究センターの一翼として、遺伝子産物であるタンパク質の解析を、主としてコンピュータを利用して行っています。

タンパク質はあらゆる生命活動を担う機能性分子です。その働きはそれぞれのタンパク質が固有の立体構造を保持することによって、はじめて発揮されます。立体構造の特異性はタンパク質のアミノ酸配列（ひいてはDNAの塩基配列）によって決定されています。ここに１次元の遺伝情報から生物体が再構成されるというカラクリの一端があります。しかし、われわれ人間はまだこの仕組みを完全には解明していません。アミノ酸配列データをコンピュータに入力し、計算によってタンパク質の立体構造を”予測”することは難しく、長年の夢でした。近年、データベースに構築された配列や立体構造の情報を駆使することによって、この予測問題を解決する方法（3D-1D法）が考案され、いくつかのタンパク質で成功を収めました。

私たちは、構造がまだ決定されていないタンパク質の立体構造予測を3D-1D法で行いつつ、方法論それ自体や、予測以外への応用なども研究しています。例えば3D-1D法の考え方の目先を変えることにより、類縁配列の検索や分類、タンパク質の突然変異体の安定性解析、及び高精度の二次構造予測などができるようになりました。また、post 3D-1D法を目指し、新しい構造予測法の研究、ゲノム配列の解析、タンパク質の変異体データベースの開発などにも挑戦しています。